Online Tools für Studienplanung, Auswertung und Publikation
Literatursuche: Die PubMed-Suche mit optimierten Suchstrategien, Treffervorschau, Zitationszahlen und Volltextweg über Ihre Bibliothek finden Sie jetzt im Hauptmenü.
Literaturliste prüfen: Der Referenzencheck prüft eine eingefügte Literaturliste auf zurückgezogene Arbeiten, Korrekturen, nicht auffindbare Quellen und den Journalstatus. Die Abfragen laufen direkt gegen die Originaldatenbanken, ohne KI.
Diese Seite sortiert bewährte, überwiegend kostenlose Werkzeuge nach der Aufgabe, die Sie gerade lösen müssen. Zu jedem Werkzeug steht, wofür es taugt und wo die Grenze liegt. Vorrang hat immer, was Ihre Einrichtung lizenziert oder Ihre Arbeitsgruppe bereits nutzt; das spart Einarbeitung und erleichtert die Zusammenarbeit.
Entscheidungshilfe: welches Werkzeug wofür?
| Ich will … | Erste Wahl | Alternative | Vertiefung |
|---|---|---|---|
| Literatur finden | PubMed | Fachdatenbanken je nach Frage | Literaturdatenbanken |
| Volltext beschaffen, den die Bibliothek nicht hat | Fernleihe der eigenen Bibliothek | subito (kostenpflichtiger Lieferdienst) | Artikel beschaffen |
| Literatur verwalten und zitieren | Zotero (kostenlos) | EndNote oder Citavi, wenn campusweit lizenziert | Literaturverwaltung |
| Fallzahl planen | G*Power | Biometrische Beratung Ihres Instituts | – |
| Teilnehmende oder Tiere zufällig zuteilen | Sealed Envelope (Listen), REDCap (falls vorhanden) | Weitere Generatoren | Randomisierung |
| Daten erfassen | REDCap über Ihre Einrichtung | Tabellenkalkulation mit festem Datenwörterbuch | – |
| Statistik rechnen | R | jamovi, JASP (kostenlos, menügeführt); SPSS oder Prism, wenn lizenziert | – |
| PCR-Primer entwerfen und prüfen | Primer3web | UCSC In-Silico PCR zur Kontrolle | – |
| Abbildungen erstellen | Inkscape (kostenlos) oder Adobe Illustrator | Servier Medical Art für Bausteine | Abbildungen, Illustrationen |
| Studie registrieren | DRKS (Deutsches Register Klinischer Studien) | ClinicalTrials.gov | Studienregistrierung |
| Reporting-Checkliste finden | EQUATOR Network | – | Paper schreiben |
| Passendes Journal finden | JANE (Abstract einfügen, ähnliche Journale) | Journal-Finder der Verlage | Journal auswählen |
Werkzeuge im Einzelnen
Literatur
- NLM PubMed: kostenlose Referenzdatenbank der US National Library of Medicine; Ausgangspunkt jeder medizinischen Recherche.
- subito: Dokumentlieferdienst wissenschaftlicher Bibliotheken; liefert Aufsätze gegen Gebühr. Vorher prüfen, ob die eigene Bibliothek oder die Fernleihe den Artikel günstiger beschafft.
- Zotero: kostenlos, quelloffen, Browser-Plugin übernimmt Referenzen direkt aus PubMed; Plugins für Word und LibreOffice sowie Integration in Google Docs. Grenze: Speicherplatz für PDFs in der Cloud ist im kostenlosen Umfang begrenzt.
Studienplanung
- G*Power (Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf): kostenlose Fallzahl- und Poweranalyse für gängige Tests; Windows und macOS (Intel). Grenze: komplexe Designs (gemischte Modelle, Cluster) gehören in die biometrische Beratung.
- Randomisierung: Für Listen mit Blöcken und Stratifizierung eignet sich der kostenlose Listengenerator von Sealed Envelope; die geplante Studie bestimmt das Verfahren. Verfahren, Werkzeuge und Fallstricke stehen auf der Seite Randomisierung und Zufallsgeneratoren.
- REDCap: webbasierte Datenerfassung mit Prüfregeln, Audit Trail und Randomisierungsmodul; wird von vielen Universitätskliniken für Studien angeboten. Nicht privat installierbar; über das Studienzentrum oder Rechenzentrum anfragen.
Auswertung
- R (mit RStudio oder Positron als Oberfläche): kostenlos, reproduzierbar über Skripte, Standard in der Biometrie. Einarbeitung lohnt sich ab der zweiten Auswertung.
- jamovi und JASP: kostenlos, Menüs wie SPSS, Ergebnisse direkt als Tabellen. Gut für Standardtests in Doktorarbeiten.
- Ausreißer: Statistische Ausreißertests ersetzen keine Plausibilitätsprüfung. Legen Sie vor der Auswertung schriftlich fest, wann Werte ausgeschlossen werden, und berichten Sie Analysen mit und ohne auffällige Werte (Empfehlung).
Labor
- Primer3web: Primerdesign nach Schmelztemperatur, Länge, GC-Gehalt und Produktgröße.
- UCSC In-Silico PCR: sucht für ein Primerpaar alle Bindungsstellen im gewählten Genom (Primer mindestens 15 Basen) und gibt die Produkte als FASTA aus. Laut UCSC können Off-Target-Stellen übersehen werden; ergänzend Primer-BLAST nutzen.
Abbildungen und Publikation
- Inkscape, GIMP: kostenlose Vektor- und Bildbearbeitung; Anleitungen auf den Seiten Hochauflösende Abbildungen und Adobe Illustrator.
- EQUATOR Network: Sammlung aller Reporting-Leitlinien (CONSORT, STROBE, PRISMA, STARD, ARRIVE u. a.).
- JANE: schlägt anhand Ihres Abstracts Journale mit thematisch ähnlichen Arbeiten vor; Treffer immer anhand der Kriterien unter Journal auswählen prüfen.
Woran Sie ein geeignetes Werkzeug erkennen
- Datenschutz: Werden personenbezogene Daten verarbeitet? Dann nur Systeme, die Ihre Einrichtung freigegeben hat.
- Reproduzierbarkeit: Lassen sich Einstellungen, Seed oder Skript speichern und im Methodenteil angeben?
- Zitierfähigkeit: Gibt es eine Versionsnummer oder eine Publikation, die Sie zitieren können?
- Verfügbarkeit: Wird das Werkzeug gepflegt (aktuelle Version, Kontakt)? Bei Projekten über mehrere Jahre wichtig.
- Anschlussfähigkeit: Kann Ihre Betreuerin oder Ihr Betreuer die Dateien öffnen und prüfen?
Empfohlene Grundausstattung für eine experimentelle oder klinische Doktorarbeit
Erfahrungsregel: Literaturverwaltung (Zotero oder Campuslizenz), ein skriptfähiges Statistikprogramm (R oder Syntax in SPSS), ein Vektorprogramm für Abbildungen (Inkscape oder Illustrator) und ein Datenerfassungssystem mit Prüfregeln (REDCap, falls angeboten). Diese vier Bausteine decken die meisten Doktorarbeiten ab; Spezialwerkzeuge kommen nur bei Bedarf dazu.
Eigene Werkzeuge von pubmed.de
Der Random Group Generator zur automatischen Erstellung von Zufallslisten wird derzeit überarbeitet; eine Ausreißeranalyse für kleine Fallzahlen befindet sich in der Testphase. Bis zur Freigabe nutzen Sie bitte die oben genannten Werkzeuge.
Fallstricke bei der Werkzeugwahl
| Fallstrick | Folge | Gegenmaßnahme |
|---|---|---|
| Patientendaten in kostenlose Onlinedienste eingegeben | Datenschutzverstoß | Nur pseudonymisierte Daten; personenbezogene Daten nur in von der Einrichtung freigegebenen Systemen (z. B. REDCap) |
| Randomisierungsliste ohne Seed und Dokumentation erzeugt | Zuteilung nicht nachvollziehbar | Seed, Parameter und Datum protokollieren (siehe Randomisierung) |
| Statistik per Mausklick ohne Protokoll | Ergebnisse nicht reproduzierbar | Syntax oder Skript speichern; Softwareversion im Methodenteil angeben |
| Fallzahl nachträglich „passend“ gerechnet | Gutachterkritik, Glaubwürdigkeitsverlust | Fallzahlplanung vor Studienbeginn, Annahmen im Protokoll |
| Literaturverwaltung erst beim Schreiben eingeführt | Doppelte Arbeit, Zitierfehler | Ab der ersten Recherche jede Quelle im Programm erfassen |
| Werkzeugwechsel mitten im Projekt | Formatverluste, verlorene Notizen | Werkzeuge zu Projektbeginn mit der Arbeitsgruppe festlegen |